保险方面，瓦尔特P99半自动手枪采用了3重保险，第一个就是枪尾红点显示的待击状态指示保险。
第二重是击针保险机构，这个机构可以让P99手枪无论是处于待击还是解脱待击状态，击针保险销在预压簧的作用下均处于下方位置，这个时候只有当扳机被扣压到释放击针的位置时，击针保险销才被扳机连杆顶起，击针头部才能穿过击针销上的通槽，打击枪弹底火发射。
第三层则是扳机保险机构，类似于格洛克的扳机保险机构，这就是P99手枪的三层保险机构，可以看得出来并没有外露的保险，通过这三层保险可以让P99手枪在使用过程的安全可靠性大大提升。
